ฉบับคอลเลกชันนี้ได้รับการวิจารณ์ในเชิงบวกเป็นส่วนใหญ่ คอลเล็กชันดังกล่าวถูกติเตียนเล็กน้อยเนื่องจากขาดบางส่วนในภาคพิเศษ และเวอร์ชันเกมคิวบ์ถูกติเตียนมากกว่าเล็กน้อยเนื่องจากไม่รวมเสียงรีมิกซ์สำหรับร็อคแมน 1-6 ความขัดแย้งที่มากกว่าคือการเปลี่ยนแปลงในการควบคุมของเวอร์ชันเกมคิวบ์ซึ่งพบว่าปุ่มยิงและกระโดดของมันกลับด้านจากการกำหนดค่าของเวอร์ชันแฟมิคอมดั้งเดิมโดยไม่มีตัวเลือกในการจัดเรียงกลับ ทำให้การผ่านด่านยากขึ้นมากเป็นผลที่ตามมา ในทางกลับกัน ความพิเศษเฉพาะในเวอร์ชันเพลย์สเตชัน 2 และเกมคิวบ์ต่างก็ได้รับการยกย่อง โดยการสัมภาษณ์เวอร์ชันเกมคิวบ์เป็นที่โปรดปราน ส่วนเวอร์ชันเอกซ์บอกซ์ได้รับการประเมินว่าดีกว่าอีกสองเวอร์ชันเล็กน้อย เนื่องจากมีเนื้อหาพิเศษที่เพิ่มเข้ามา รวมถึงโบนัสพิเศษจากเวอร์ชันเพลย์สเตชัน 2 และเกมคิวบ์ อย่างไรก็ตาม เกมนี้ได้รับคะแนน 8.0 (เทียบกับ 8.5 สำหรับอีกสองเวอร์ชัน) จากเว็บไซต์ไอจีเอ็นเนื่องจากมาช้า นอกเหนือจากข้อบกพร่องด้านกราฟิกเป็นครั้งคราวที่ขึ้นอยู่กับการตั้งค่าหน้าจอ ซึ่งจะชัดเจนยิ่งขึ้นเมื่อเล่นในระบบเอกซ์บอกซ์ 360

ทั้งนี้ เมกาแมนแอนนิเวอร์ซารีคอลเลกชันประสบความสำเร็จทางการเงิน ซึ่งเมกาแมนแอนนิเวอร์ซารีคอลเลกชันเวอร์ชันเพลย์สเตชัน 2 และเกมคิวบ์มียอดขายรวมกันกว่า 500,000 ชุดในเวลาไม่ถึงหกเดือน[25] เนื่องจากความนิยมของฉบับแอนนิเวอร์ซารีคอลเลกชันในหมู่แฟน ๆ ของซีรีส์นี้ ทางบริษัทแคปคอมจึงตามมาด้วยเมกาแมน X คอลเลกชัน โดยเป็นการรวบรวมที่คล้ายกันที่ประกอบด้วยเกมในซีรีส์ร็อคแมน X ซึ่งเปิดตัวเฉพาะในอเมริกาเหนือเมื่อวันที่ 10 มกราคม ค.ศ. 2006[26] อีกครั้งที่แคปคอมตามมาด้วยเมกาแมนซีโรคอลเลกชัน ซึ่งเป็นการรวบรวมเกมทั้งหมดจากซีรี่ส์ร็อคแมนซีโร่ที่วางจำหน่ายใน ค.ศ. 2010 สำหรับนินเท็นโด ดีเอส กระทั่งใน ค.ศ. 2015 ทางแคปคอมได้เปิดตัวเมกาแมนเลกาซีคอลเลกชัน ซึ่งมีเกมดั้งเดิม 6 ภาคในระบบแฟมิคอม พร้อมฟีเจอร์โบนัสและคุณภาพที่ดีขึ้น และใน ค.ศ. 2017 เมกาแมนเลกาซีคอลเลกชัน 2 ได้รับการเปิดตัว และมีภาค 7 และ 8 บวกภาค 9 และภาค 10